Notebooky Lenovo ThinkPad vždy poskytovaly vysokou míru kompatibilitu s Linuxem a na PC s technologií Secure Boot lze běžně Linux nainstalovat.
Problémy s instalací Linuxu na noteboocích Lenovo způsobuje podle vyjádření mluvčího Lenova optimalizace výkonu u některých modelů pomocí zapojení SSD disků do RAID. Lenovo prý neblokuje instalaci jiných operačních systémů úmyslně a u řady produktů dokonce poskytuje certifikát kompatibility s Linuxem. Pro nekompatibilní modely by bylo nutné upravit jádro Linuxu tak, aby podporovalo funkce jako zapojení SSD disků do RAID.
Problém je tedy v pochybné implementaci BIOSU u notebooků Lenovo, nikoli komplotu s Microsoftem. Přesto trend zavádění UEFI Secure Boot a technologie Boot Guard od Intelu stále více ztěžuje příznivcům Linuxu a jiných open-sourcových systémů instalaci softwaru podle své volby na moderních počítačích.
Pro uživatele z toho vyplývá nutnost pečlivě ověřit kompatibilitu před koupí stolního či přenosného počítače, na němž chtějí provozovat jiný operační systém než předinstalovaná Windows. Nejjednodušší je koupit notebook již s Linuxem, což není dnes již tak vzácný jev jako dřív.